Мне этот вариант больше нравится.
"и отмеченное только темой Шора Поход Братства/Опасные перевалы, той же самой темой, которая звучала, когда Братство начало преодолевать крутые склоны Карадраса."
Один только вопрос, нужно ли для читателя уточнять, что Поход Братства - это название группы тем, а не отдельной темы? А то у нас перед этим через наклонную черту обозначались "гибриды" из двух тем.